DNA Sequencing , nr 233
Bastienne Wentzel | maart 2007
DNA is het molecuul van het leven. De code waarin
- alle instructies voor onze cellen wordt geschreven
- bestaat uit de letters A, C, G en T: de vier basen
- die de bekende wenteltrapstructuur van DNA vormen. Het
- lezen van die code komt neer op het bepalen van de basenvolgorde,
- ook wel sequencing genoemd. Dit kunstje beheersen
- biochemici al dertig jaar. Maar dan met relatief kleine
- genomen of met delen van grotere genomen. Ontrafeling
- van het menselijke DNA met drie miljard basenparen bleek
heel wat moeilijker.
In 1990 startte het eerste project om de
sequentie van het menselijk genoom te bepalen. Sindsdien
is de DNA-volgorde van liefst 95 procent van het menselijk
genoom ontcijferd.
Het geheim van die ontcijfering is de polymerase kettingreactie
(PCR), waarbij de DNA-bouwstenen zich vanzelf
aaneen rijgen. In 1977 ontwikkelde Frederick Sanger een
methode waarmee de volgorde waarin dit gebeurt kan worden
afgelezen met een kleurcode. De oorspronkelijke aanpak
was langzaam en arbeidsintensief. Tegenwoordig moet alles
sneller en goedkoper. Slimme trucs en krachtige computers
maken dat de nieuwste sequencers een miljard basenparen
per run analyseren in plaats van een paar miljoen. Kosten:
bijna een miljoen euro voor een compleet humaan genoom.
Het ultieme doel is die prijs omlaag te brengen naar duizend
euro. Maar dat gaat nog wel even duren.
In deze Chemische Feitelijkheid
• De Context: Wat zijn de bouwstenen van DNA en waarom
willen we hun volgorde weten?
• De Basis: Hoe kom je aan DNA en hoe bepaal je
vervolgens de volgorde van de basen?
• De Diepte: Moderne analyse- en computertechnieken
maken DNA-sequencing steeds sneller en goedkoper. Hoe
werkt dat? |
Alles lezen en onbeperkte toegang?
Neem nu een abonnement op Chemische Feitelijkheden en ontvang 10 nieuwe edities per jaar en toegang tot het online archief.
Drie openbare nummers
Geen toegang tot Chemische Feitelijkheden en wilt u er meer over weten?
Bekijk deze gratis openbare nummers
Bestellen
Een abonnement op hét naslagwerk over chemie en moleculaire wetenschap? Dat kan via MijnTijdschrift. Iedere editie behandelt nieuwe inzichten en ontwikkelingen rondom materialen, gezondheid, voeding, energie en milieu.
Losse nummers zijn vanaf € 9,95 te bestellen bij MijnTijdschrift. Kijk hier voor meer informatie.
De Koninklijke Nederlandse Chemische Vereniging is de beroepsvereniging van en voor mensen die werkzaam zijn of studeren in de chemie, life sciences en procestechnologie. De KNCV wil een schakel zijn tussen bedrijven en mensen. Zie voor meer info: www.kncv.nl.
